基因敲降
是指在细胞或生物体中通过RNA干扰(RNA interference,RNAi)等方法降低目标基因表达水平,使其功能受到抑制。RNAi通常通过合成人工转录后小干扰RNA(siRNA)或利用稳定的反义RNA(shRNA)介导靶向降解mRNA来实现。由于RNAi的效果通常是部分抑制目标基因的表达,因此被称为基因敲低。基因敲低可以帮助研究者探究特定基因的生物学功能、代谢途径等,是一种常用的基因功能研究方法。
基因敲降载体:
(1)siRNA载体:短小的干扰RNA序列,通过RNAi途径靶向RNA降解或保护mRNA免受翻译;
(2)shRNA载体:较长的干扰RNA序列,可以形成稳定的hairpin结构,通过RNAi途径实现靶向RNA降解或保护mRNA免受翻译,有效性比siRNA更高;
(3)CRISPRi载体:包含CRISPRi靶向序列和转录抑制子,通过抑制靶向基因的转录水平实现基因敲低效果。
基因敲降载体的构建方法:
(1)设计目标基因的干扰序列,通常采用在线设计工具或经验公式来计算;
(2)合成干扰序列的DNA或RNA片段,克隆到转录载体中,生成siRNA或shRNA表达载体;
(3)将siRNA或shRNA表达载体转化至大肠杆菌中,进行筛选鉴定;
(4)提取筛选出的重组质粒,通过腺病毒、腺相关病毒等途径将其导入到目标细胞中。