SingleCellExperiment
Biostrings
主要内容是单细胞分析、差异表达基因分析、富集分析、伪时序分析。。。。。。
由于R处理大数据较慢，部分使用python
# 参考资料 {.unnumbered style="color:red"} - [Orchestrating Single-Cell Analysis with ***Bioconductor***](https://bioconductor.org/books/release/OSCA/) - [***Seurat***](https://satijalab.org/seurat/) - [DESeq2](https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DESeq2/inst/doc/DESeq2.html) - [clusterProfiler](https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/) - 。。。 主要内容是单细胞分析、差异表达基因分析、富集分析、伪时序分析。。。。。。 由于R处理大数据较慢，部分使用python - [scanpy](https://scanpy.readthedocs.io/en/stable/)